韦德群 , 周涛^* , 江维克 , 李军 , 张成刚

贵阳中医学院,贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2017年11月06日    接受日期: 2017年12月12日    发表日期: 2019年01月18日

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为丰富太子参分子标记库、开发太子参 SSR标记、寻找有效的太子参种源鉴定方法。本研究运用MISA、 Primer3 等分子生物学分析工具，从太子参转录组中搜索获得 11 297 个 SSR 位点， 其出现频率为8.87%，分布距离为平均每 10 kb 有 1.47 个 SSR 位点，其中主要重复类型是单核苷酸重复； 11 297 个 SSR位点中不同核苷酸基序类型的 SSR 有 259 种，主要以单核苷酸重复基序 A/T 为主，其次是三核苷酸重复基序 AAT/ATT。在此基础上设计、筛选得到 16 821 对特异性引物，其中针对高多态性 SSR 序列的引物有8 706对，随机挑选其中的 20 对引物对来源于贵州、江苏、福建的 6 个太子参样品 DNA进行 PCR 扩增，其扩增成功率达 70%~80%。太子参转录组 SSR 分布密度大、类型丰富、多态性潜能高、通用性好，可为开发太子参功能性标记提供前期基础，在太子参种质资源评价和优质种源筛选等方面具有极大的开发价值和良好的应用前景。

太子参；SSR；转录组；位点信息